Je suis juste sûr que ça s'est passé comme ça pour moi en 2009...
Après, il n'est pas impossible que les règles aient changé, voire que parfois elles soit appliquées différemment, mais perso je n'ai rencontré personne qui aie eu des soucis de passage de frontières, sauf au Panama ou le soucis a vite été réglé par l'achat d'un billet de bus à ~30.-$.
Je pense que au pire si on te laisse pas passer une frontière, tu achète un ticket de bus de sortie et ça devrait le faire... cette compagnie traverse toute l'Amérique Centrale:
http://www.ticabus.com/ , elle est plus chère que les bus locaux, et moins "typique", mais elle est plus rapide et peut te vendre de ticket d'entrée sortie de tout les pays d'Amérique centrale depuis n'importe lequel de ces pays...